Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NTRK3Q16288 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NTRK3Q16288 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NTRK3Q16288 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
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