Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAMP3Q15836 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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