Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA6Q15825 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA6Q15825 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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