Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SURF1Q15526 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SURF1Q15526 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SURF1Q15526 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SURF1Q15526 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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