Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP1Q15431 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP1Q15431 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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