Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF1Q14990 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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