Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN1Q14457 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BECN1Q14457 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BECN1Q14457 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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