Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKP1Q13835 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKP1Q13835 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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