Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALCAMQ13740 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALCAMQ13740 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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