Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD4Q13485 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD4Q13485 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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