Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDE3BQ13370 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDE3BQ13370 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PDE3BQ13370 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PDE3BQ13370 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
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