Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 38.4
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TARDBPQ13148 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.735e-12■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.365e-12■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 516.19■□□□□ 0.185e-12■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.165e-12■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 514.09□□□□□ -0.155e-12■■■■■ 38.4
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TARDBPQ13148 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.545e-12■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 511.62□□□□□ -0.555e-12■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 NARF-211ENST00000578820 625 ntTSL 311.22□□□□□ -0.615e-12■■■■■ 38.4
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TARDBPQ13148 NARF-226ENST00000584513 500 ntTSL 39.98□□□□□ -0.815e-12■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 NARF-222ENST00000583908 430 ntTSL 39.72□□□□□ -0.855e-12■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 NARF-227ENST00000584965 300 ntTSL 39.1□□□□□ -0.955e-12■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 RUNX1-208ENST00000455571 610 ntTSL 318.09■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 38.3
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TARDBPQ13148 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 38.3
TARDBPQ13148 MXD1-204ENST00000435990 860 ntTSL 312.58□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 38.3
TARDBPQ13148 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.374e-11■■■■■ 38.3
TARDBPQ13148 WDR27-206ENST00000474018 951 ntTSL 217.36■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 38.3
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TARDBPQ13148 EAF1-201ENST00000396842 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 38.2
TARDBPQ13148 EAF1-203ENST00000617675 556 ntTSL 46.34□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 38.2
TARDBPQ13148 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 312.35□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 38.2
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TARDBPQ13148 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 38.2
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TARDBPQ13148 SLC43A1-210ENST00000534105 580 ntTSL 517.42■□□□□ 0.388e-7■■■■■ 38.1
TARDBPQ13148 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 38.1
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TARDBPQ13148 BX293535.1-201ENST00000443579 283 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 38
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TARDBPQ13148 LINC01021-203ENST00000510165 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 37.9
TARDBPQ13148 LINC01021-205ENST00000514255 545 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 37.9
TARDBPQ13148 LINC01021-206ENST00000514844 667 ntTSL 1 (best)6.69□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 37.9
TARDBPQ13148 LINC01021-201ENST00000503107 458 ntTSL 1 (best)4.46□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 37.9
TARDBPQ13148 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.741e-7■■■■■ 37.9
TARDBPQ13148 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.627e-10■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.517e-10■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 DCAF12-201ENST00000361264 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.782e-28■■■■■ 37.8
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TARDBPQ13148 TMEM116-202ENST00000437003 2761 nt11.84□□□□□ -0.511e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-11■■■■■ 37.8
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TARDBPQ13148 RASGRP4-203ENST00000433821 2941 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-11■■■■■ 37.8
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