Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TROQ12816 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TROQ12816 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TROQ12816 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TROQ12816 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TROQ12816 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TROQ12816 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TROQ12816 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TROQ12816 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TROQ12816 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TROQ12816 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
TROQ12816 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TROQ12816 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TROQ12816 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TROQ12816 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TROQ12816 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TROQ12816 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TROQ12816 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TROQ12816 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TROQ12816 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TROQ12816 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TROQ12816 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TROQ12816 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TROQ12816 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TROQ12816 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TROQ12816 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
TROQ12816 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TROQ12816 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TROQ12816 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TROQ12816 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TROQ12816 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TROQ12816 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TROQ12816 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TROQ12816 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TROQ12816 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TROQ12816 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TROQ12816 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TROQ12816 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TROQ12816 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TROQ12816 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TROQ12816 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TROQ12816 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TROQ12816 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TROQ12816 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TROQ12816 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TROQ12816 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TROQ12816 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TROQ12816 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TROQ12816 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TROQ12816 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
TROQ12816 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
TROQ12816 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TROQ12816 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TROQ12816 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TROQ12816 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TROQ12816 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TROQ12816 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TROQ12816 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TROQ12816 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TROQ12816 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TROQ12816 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TROQ12816 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TROQ12816 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TROQ12816 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TROQ12816 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TROQ12816 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TROQ12816 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TROQ12816 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TROQ12816 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TROQ12816 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TROQ12816 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TROQ12816 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
TROQ12816 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TROQ12816 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TROQ12816 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TROQ12816 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
TROQ12816 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
TROQ12816 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TROQ12816 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TROQ12816 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TROQ12816 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TROQ12816 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TROQ12816 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TROQ12816 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TROQ12816 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TROQ12816 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TROQ12816 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TROQ12816 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TROQ12816 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
TROQ12816 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TROQ12816 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TROQ12816 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TROQ12816 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TROQ12816 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TROQ12816 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TROQ12816 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TROQ12816 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TROQ12816 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TROQ12816 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TROQ12816 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
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