Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 DYS1YHR068W 1164 nt6.29□□□□□ -1.4
YPQ1Q12010 AIM24YJR080C 1185 nt6.29□□□□□ -1.4
YPQ1Q12010 MCH1YDL054C 1461 nt6.28□□□□□ -1.4
YPQ1Q12010 NTG1YAL015C 1200 nt6.28□□□□□ -1.4
YPQ1Q12010 YKR032WYKR032W 315 nt6.28□□□□□ -1.4
YPQ1Q12010 RPL5YPL131W 894 nt6.28□□□□□ -1.4
YPQ1Q12010 DAL7YIR031C 1665 nt6.28□□□□□ -1.4
YPQ1Q12010 NHA1YLR138W 2958 nt6.28□□□□□ -1.4
YPQ1Q12010 CCC2YDR270W 3015 nt6.28□□□□□ -1.4
YPQ1Q12010 AFG2YLR397C 2343 nt6.27□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 DFM1YDR411C 1026 nt6.27□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 ASK1YKL052C 879 nt6.27□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 ADE12YNL220W 1302 nt6.26□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 YLR312CYLR312C 1197 nt6.26□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 MSB3YNL293W 1902 nt6.25□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 HDA1YNL021W 2121 nt6.25□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 SPO7YAL009W 780 nt6.25□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 LCB3YJL134W 1230 nt6.25□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 PEX13YLR191W 1161 nt6.25□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 HXT13YEL069C 1695 nt6.25□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 ADE17YMR120C 1779 nt6.25□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 YNL040WYNL040W 1371 nt6.24□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 UGX2YDL169C 672 nt6.24□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 YHC3YJL059W 1227 nt6.24□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 YPL041CYPL041C 624 nt6.24□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 YDL129WYDL129W 876 nt6.23□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 LDS1YAL018C 978 nt6.23□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 MTC2YKL098W 1074 nt6.23□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 YLR123CYLR123C 330 nt6.23□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 RKI1YOR095C 777 nt6.23□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 KTR1YOR099W 1182 nt6.23□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 PMT3YOR321W 2262 nt6.23□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 HAL5YJL165C 2568 nt6.22□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 ISN1YOR155C 1353 nt6.22□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 AQR1YNL065W 1761 nt6.22□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 snR82snR82 268 nt6.22□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 RRS1YOR294W 612 nt6.22□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 CMK2YOL016C 1344 nt6.22□□□□□ -1.41
YPQ1Q12010 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.21□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 RPN11YFR004W 921 nt6.21□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.21□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 MDM31YHR194W 1740 nt6.21□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 GEF1YJR040W 2340 nt6.21□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 EXG1YLR300W 1347 nt6.21□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 SMC5YOL034W 3282 nt6.21□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 CDC34YDR054C 888 nt6.2□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 POP5YAL033W 522 nt6.2□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 CIN4YMR138W 576 nt6.2□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 YMC1YPR058W 924 nt6.2□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 NTE1YML059C 5040 nt6.2□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 QCR8YJL166W 285 nt6.19□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 MRPS12YNR036C 462 nt6.19□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 MRPS16YPL013C 366 nt6.19□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.18□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 COX20YDR231C 618 nt6.18□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 TMT1YER175C 900 nt6.18□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 IES2YNL215W 963 nt6.18□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 TKL2YBR117C 2046 nt6.18□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 COR1YBL045C 1374 nt6.18□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 HRQ1YDR291W 3234 nt6.18□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 UTR2YEL040W 1404 nt6.17□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 ATO2YNR002C 849 nt6.17□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 PXL1YKR090W 2121 nt6.17□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 SEC23YPR181C 2307 nt6.16□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 EFM1YHL039W 1758 nt6.16□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 PRI2YKL045W 1587 nt6.16□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.16□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 SSP120YLR250W 705 nt6.16□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.16□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 YCK1YHR135C 1617 nt6.16□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 CIR2YOR356W 1896 nt6.15□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 TPO3YPR156C 1869 nt6.15□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 CDC19YAL038W 1503 nt6.15□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 PYK2YOR347C 1521 nt6.15□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 RSC30YHR056C 2652 nt6.15□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 RPE1YJL121C 717 nt6.15□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 ATG12YBR217W 561 nt6.15□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 MRPS5YBR251W 924 nt6.15□□□□□ -1.42
YPQ1Q12010 KIN1YDR122W 3195 nt6.15□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 YEL068CYEL068C 333 nt6.14□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 LEU5YHR002W 1074 nt6.14□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 RPL10YLR075W 666 nt6.14□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 TSA1YML028W 591 nt6.14□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 SNO4YMR322C 714 nt6.14□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 HSP33YOR391C 714 nt6.14□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 HSP32YPL280W 714 nt6.14□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 YTP1YNL237W 1380 nt6.14□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 RGT2YDL138W 2292 nt6.14□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 PYC2YBR218C 3543 nt6.13□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 OPI8YKR035C 642 nt6.13□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 IDP3YNL009W 1263 nt6.13□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 ELA1YNL230C 1140 nt6.13□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 WHI2YOR043W 1461 nt6.13□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 MRK1YDL079C 1506 nt6.12□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 YDL119CYDL119C 924 nt6.12□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 SRF1YDL133W 1314 nt6.12□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 RPR2YIR015W 435 nt6.12□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 HST3YOR025W 1344 nt6.12□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 HEL1YKR017C 1656 nt6.11□□□□□ -1.43
YPQ1Q12010 CDC13YDL220C 2775 nt6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms