Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPSF1Q10570 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPSF1Q10570 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CPSF1Q10570 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
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