Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC15Q0P6D6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC15Q0P6D6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms