Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD300CQ08708 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD300CQ08708 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms