Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX9Q08211 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms