Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 CNOT2-237ENST00000552319 783 ntTSL 58.99□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-217ENST00000549443 457 ntTSL 48.99□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 311.31□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 510.99□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 29.99□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.72e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.82e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.822e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.822e-7■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 PCF11-206ENST00000533018 580 ntTSL 322.93■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 PCF11-203ENST00000530304 2649 ntTSL 1 (best)22.31■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 PCF11-204ENST00000530660 3309 ntTSL 215.98■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 35.7
FMR1Q06787 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 27.03□□□□□ -1.282e-11■■■■■ 35.6
FMR1Q06787 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 35.5
FMR1Q06787 AC134978.1-201ENST00000579480 788 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.345e-19■■■■■ 35.5
FMR1Q06787 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.917e-8■■■■■ 35.5
FMR1Q06787 ZNF598-206ENST00000564824 2147 ntTSL 528.9■■■□□ 2.223e-9■■■■■ 35.5
FMR1Q06787 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.943e-9■■■■■ 35.5
FMR1Q06787 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.113e-9■■■■■ 35.5
FMR1Q06787 ZNF598-203ENST00000562988 3382 ntTSL 521.9■■□□□ 1.13e-9■■■■■ 35.5
FMR1Q06787 ZNF598-207ENST00000565396 4457 ntTSL 221.39■■□□□ 1.013e-9■■■■■ 35.5
FMR1Q06787 IQGAP1-207ENST00000559682 376 ntTSL 28.06□□□□□ -1.121e-11■■■■■ 35.5
FMR1Q06787 VARS-221ENST00000463184 619 ntTSL 225.83■■□□□ 1.732e-9■■■■■ 35.2
FMR1Q06787 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 35.2
FMR1Q06787 DDB1-219ENST00000541513 958 ntTSL 47.43□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 35.2
FMR1Q06787 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.199e-12■■■■■ 35.1
FMR1Q06787 DNAJB6-216ENST00000487480 5173 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.679e-12■■■■■ 35.1
FMR1Q06787 ACSL4-212ENST00000514500 696 ntTSL 517.76■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 35
FMR1Q06787 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 35
FMR1Q06787 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 35
FMR1Q06787 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.042e-9■■■■■ 35
FMR1Q06787 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 326.02■■□□□ 1.767e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 GEMIN4-204ENST00000573482 1015 ntTSL 223.74■■□□□ 1.397e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 VOPP1-214ENST00000462326 536 ntTSL 423.6■■□□□ 1.377e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 GEMIN4-203ENST00000570364 1048 ntTSL 323■■□□□ 1.277e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 422.54■■□□□ 1.27e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 421.77■■□□□ 1.087e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 BCAR1-212ENST00000563038 2692 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.687e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.677e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.527e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.187e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 35
FMR1Q06787 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)15.74■□□□□ 0.117e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.057e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 MICAL3-207ENST00000461307 5981 ntTSL 513.86□□□□□ -0.197e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.37e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 GEMIN4-207ENST00000576778 4729 ntBASIC12.57□□□□□ -0.47e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ZNF876P-201ENST00000356347 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.427e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.467e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 GEMIN4-201ENST00000319004 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.487e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 MICAL3-210ENST00000495076 5113 ntTSL 512□□□□□ -0.497e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 MICAL3-204ENST00000414725 4756 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.557e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.561e-18■■■■■ 35
FMR1Q06787 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.717e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 LARP4B-203ENST00000412411 432 ntTSL 39.89□□□□□ -0.837e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 PCDH9-205ENST00000614931 461 ntTSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.857e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.877e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.877e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ERBIN-211ENST00000507490 337 ntTSL 38.62□□□□□ -1.037e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ACSL4-207ENST00000504383 683 ntTSL 28.44□□□□□ -1.067e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.17e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC8.06□□□□□ -1.127e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.167e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.547e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.557e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.777e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.797e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.827e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.867e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.927e-10■■■■■ 35
FMR1Q06787 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 35
FMR1Q06787 DDB1-211ENST00000538280 227 ntTSL 310.61□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 34.9
FMR1Q06787 AC112178.1-202ENST00000446720 427 ntTSL 37.1□□□□□ -1.274e-11■■■■■ 34.8
FMR1Q06787 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.44e-6■■■■■ 34.8
FMR1Q06787 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 34.7
FMR1Q06787 NOL11-206ENST00000581375 2448 ntTSL 28.63□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 34.7
FMR1Q06787 RPL13A-202ENST00000467825 660 ntTSL 519.18■□□□□ 0.661e-323■■■■■ 34.6
FMR1Q06787 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.239e-7■■■■■ 34.6
FMR1Q06787 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 34.6
FMR1Q06787 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 34.6
FMR1Q06787 AP1B1-209ENST00000472057 727 ntTSL 317.13■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 VARS-226ENST00000483275 450 ntTSL 318.33■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 RAB31-211ENST00000583137 714 ntTSL 331.93■■■□□ 2.75e-8■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 RAB31-205ENST00000578734 783 ntTSL 329.83■■■□□ 2.375e-8■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 RAB31-210ENST00000581109 469 ntTSL 329.83■■■□□ 2.375e-8■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-18■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-18■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 C18orf25-202ENST00000588730 586 ntTSL 515.28■□□□□ 0.042e-18■■■■■ 34.5
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 94.4 ms