Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 YMR279CYMR279C 1623 nt6.09□□□□□ -1.43
ATG17Q06410 MSC3YLR219W 2187 nt6.08□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.08□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 FAL1YDR021W 1200 nt6.08□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 YLR358CYLR358C 564 nt6.08□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 MKK2YPL140C 1521 nt6.08□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 LAT1YNL071W 1449 nt6.08□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 HRQ1YDR291W 3234 nt6.07□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 MDE1YJR024C 735 nt6.07□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 VMA4YOR332W 702 nt6.07□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 PAB1YER165W 1734 nt6.07□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 CLB1YGR108W 1416 nt6.07□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 TRP5YGL026C 2124 nt6.07□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 XBP1YIL101C 1944 nt6.06□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 YGL235WYGL235W 537 nt6.06□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 POP5YAL033W 522 nt6.06□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 IFA38YBR159W 1044 nt6.06□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 PET112YBL080C 1626 nt6.06□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 RPE1YJL121C 717 nt6.05□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 RUF23RUF23 254 nt6.05□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 YCL049CYCL049C 939 nt6.05□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 IRS4YKR019C 1848 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 TNA1YGR260W 1605 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 IMA2YOL157C 1770 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 YGR054WYGR054W 1929 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 HSP104YLL026W 2727 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 CWC27YPL064C 906 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 MRP51YPL118W 1035 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 SCT1YBL011W 2280 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 PIH1YHR034C 1035 nt6.03□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 RHO4YKR055W 876 nt6.03□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 YHK8YHR048W 1545 nt6.03□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 GPB2YAL056W 2643 nt6.03□□□□□ -1.44
ATG17Q06410 EMW1YNL313C 2715 nt6.02□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 MEH1YKR007W 555 nt6.02□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 LYS1YIR034C 1122 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 BUD20YLR074C 501 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 MET8YBR213W 825 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 NUP49YGL172W 1419 nt6□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 RPL10YLR075W 666 nt6□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 PTH2YBL057C 627 nt6□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 SCO2YBR024W 906 nt6□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 ECM31YBR176W 939 nt6□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 CRZ1YNL027W 2037 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 SFB3YHR098C 2790 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 MCH1YDL054C 1461 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 CHO1YER026C 831 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 YPL067CYPL067C 597 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 YMC1YPR058W 924 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 TKL1YPR074C 2043 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 TMT1YER175C 900 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 PDA1YER178W 1263 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 SPG1YGR236C 288 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 YKL223WYKL223W 333 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 GEP5YLR091W 882 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 YOL131WYOL131W 327 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 DAP1YPL170W 459 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 TEL2YGR099W 2067 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 VPS70YJR126C 2436 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 SHO1YER118C 1104 nt5.97□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 MRPL23YOR150W 492 nt5.97□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 snR30snR30 606 nt5.97□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 TRP3YKL211C 1455 nt5.96□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 EPS1YIL005W 2106 nt5.96□□□□□ -1.45
ATG17Q06410 RPT3YDR394W 1287 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 YRB2YIL063C 984 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 YKL077WYKL077W 1179 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 CPA1YOR303W 1236 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 GAT1YFL021W 1533 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 TBF1YPL128C 1689 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 GEX1YCL073C 1848 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 GEX2YKR106W 1848 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 CWC21YDR482C 408 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 EDC2YER035W 438 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 TRR2YHR106W 1029 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 ASN1YPR145W 1719 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 CIT3YPR001W 1461 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 EXG1YLR300W 1347 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 YIR007WYIR007W 2295 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 VTH1YIL173W 4650 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 VTH2YJL222W 4650 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 YAR064WYAR064W 300 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 POR1YNL055C 852 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 PRS4YBL068W 981 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 GSY2YLR258W 2118 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 GUA1YMR217W 1578 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 TIM22YDL217C 624 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 VMA3YEL027W 483 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 KAE1YKR038C 1161 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG17Q06410 FAT3YKL187C 2253 nt5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.5 ms