Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZNF85Q03923 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF85Q03923 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF85Q03923 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF85Q03923 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF85Q03923 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF85Q03923 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF85Q03923 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF85Q03923 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF85Q03923 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF85Q03923 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF85Q03923 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF85Q03923 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF85Q03923 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF85Q03923 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF85Q03923 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF85Q03923 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF85Q03923 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF85Q03923 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF85Q03923 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF85Q03923 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF85Q03923 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF85Q03923 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF85Q03923 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF85Q03923 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms