Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFF2Q03403 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFF2Q03403 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms