Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD83Q01151 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD83Q01151 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD83Q01151 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD83Q01151 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD83Q01151 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD83Q01151 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD83Q01151 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD83Q01151 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD83Q01151 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD83Q01151 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD83Q01151 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD83Q01151 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD83Q01151 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD83Q01151 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD83Q01151 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD83Q01151 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD83Q01151 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD83Q01151 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD83Q01151 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD83Q01151 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD83Q01151 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD83Q01151 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD83Q01151 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD83Q01151 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD83Q01151 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD83Q01151 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD83Q01151 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD83Q01151 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD83Q01151 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD83Q01151 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD83Q01151 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD83Q01151 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CD83Q01151 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD83Q01151 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD83Q01151 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD83Q01151 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD83Q01151 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD83Q01151 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD83Q01151 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD83Q01151 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD83Q01151 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD83Q01151 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD83Q01151 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CD83Q01151 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD83Q01151 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD83Q01151 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD83Q01151 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD83Q01151 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD83Q01151 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD83Q01151 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD83Q01151 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD83Q01151 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD83Q01151 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD83Q01151 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD83Q01151 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD83Q01151 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD83Q01151 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD83Q01151 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD83Q01151 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD83Q01151 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD83Q01151 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CD83Q01151 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD83Q01151 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD83Q01151 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD83Q01151 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD83Q01151 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD83Q01151 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD83Q01151 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms