Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN7AQ01118 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCN7AQ01118 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN7AQ01118 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.6 ms