Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYBPC1Q00872 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms