Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VLDLRP98155 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VLDLRP98155 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VLDLRP98155 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms