Protein–RNA interactions for Protein: P78560

CRADD, Death domain-containing protein CRADD, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRADDP78560 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRADDP78560 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRADDP78560 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRADDP78560 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRADDP78560 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRADDP78560 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRADDP78560 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRADDP78560 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRADDP78560 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRADDP78560 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRADDP78560 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRADDP78560 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRADDP78560 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRADDP78560 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRADDP78560 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRADDP78560 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRADDP78560 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRADDP78560 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRADDP78560 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRADDP78560 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRADDP78560 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRADDP78560 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRADDP78560 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRADDP78560 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRADDP78560 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRADDP78560 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRADDP78560 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRADDP78560 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRADDP78560 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRADDP78560 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRADDP78560 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRADDP78560 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRADDP78560 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRADDP78560 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRADDP78560 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRADDP78560 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRADDP78560 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRADDP78560 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRADDP78560 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRADDP78560 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRADDP78560 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRADDP78560 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRADDP78560 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRADDP78560 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRADDP78560 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRADDP78560 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRADDP78560 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRADDP78560 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRADDP78560 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRADDP78560 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRADDP78560 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRADDP78560 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRADDP78560 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRADDP78560 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRADDP78560 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRADDP78560 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRADDP78560 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRADDP78560 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRADDP78560 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRADDP78560 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRADDP78560 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRADDP78560 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRADDP78560 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRADDP78560 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRADDP78560 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRADDP78560 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRADDP78560 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRADDP78560 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRADDP78560 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRADDP78560 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRADDP78560 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRADDP78560 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRADDP78560 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRADDP78560 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRADDP78560 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRADDP78560 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRADDP78560 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRADDP78560 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRADDP78560 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms