Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSPAN5P62079 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN5P62079 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN5P62079 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms