Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVFC1P60507 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVFC1P60507 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ERVFC1P60507 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms