Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3EP60228 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3EP60228 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms