Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA1P59665 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA1P59665 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA1P59665 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA1P59665 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA1P59665 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA1P59665 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA1P59665 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA1P59665 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA1P59665 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEFA1P59665 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms