Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CABP4P57796 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CABP4P57796 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CABP4P57796 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CABP4P57796 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CABP4P57796 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CABP4P57796 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CABP4P57796 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CABP4P57796 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CABP4P57796 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CABP4P57796 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CABP4P57796 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CABP4P57796 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CABP4P57796 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CABP4P57796 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CABP4P57796 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CABP4P57796 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CABP4P57796 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CABP4P57796 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CABP4P57796 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CABP4P57796 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CABP4P57796 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CABP4P57796 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CABP4P57796 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CABP4P57796 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CABP4P57796 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CABP4P57796 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CABP4P57796 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CABP4P57796 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CABP4P57796 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CABP4P57796 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CABP4P57796 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CABP4P57796 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CABP4P57796 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CABP4P57796 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CABP4P57796 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CABP4P57796 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CABP4P57796 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CABP4P57796 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CABP4P57796 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CABP4P57796 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CABP4P57796 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CABP4P57796 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CABP4P57796 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CABP4P57796 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CABP4P57796 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CABP4P57796 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CABP4P57796 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CABP4P57796 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CABP4P57796 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CABP4P57796 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CABP4P57796 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CABP4P57796 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CABP4P57796 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CABP4P57796 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CABP4P57796 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CABP4P57796 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CABP4P57796 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CABP4P57796 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CABP4P57796 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CABP4P57796 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CABP4P57796 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CABP4P57796 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CABP4P57796 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CABP4P57796 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CABP4P57796 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CABP4P57796 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CABP4P57796 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CABP4P57796 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CABP4P57796 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CABP4P57796 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CABP4P57796 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CABP4P57796 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CABP4P57796 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CABP4P57796 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CABP4P57796 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CABP4P57796 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CABP4P57796 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CABP4P57796 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CABP4P57796 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CABP4P57796 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CABP4P57796 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CABP4P57796 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CABP4P57796 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CABP4P57796 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CABP4P57796 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CABP4P57796 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CABP4P57796 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CABP4P57796 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CABP4P57796 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CABP4P57796 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CABP4P57796 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CABP4P57796 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CABP4P57796 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CABP4P57796 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CABP4P57796 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CABP4P57796 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CABP4P57796 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CABP4P57796 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CABP4P57796 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms