Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX16P57768 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX16P57768 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX16P57768 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX16P57768 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX16P57768 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX16P57768 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX16P57768 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX16P57768 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX16P57768 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX16P57768 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX16P57768 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX16P57768 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX16P57768 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX16P57768 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX16P57768 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX16P57768 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX16P57768 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX16P57768 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX16P57768 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX16P57768 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX16P57768 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX16P57768 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX16P57768 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX16P57768 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX16P57768 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX16P57768 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX16P57768 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX16P57768 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX16P57768 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX16P57768 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX16P57768 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX16P57768 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX16P57768 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX16P57768 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX16P57768 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX16P57768 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX16P57768 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX16P57768 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX16P57768 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX16P57768 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX16P57768 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX16P57768 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX16P57768 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX16P57768 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX16P57768 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX16P57768 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX16P57768 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX16P57768 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX16P57768 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX16P57768 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX16P57768 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX16P57768 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX16P57768 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX16P57768 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX16P57768 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX16P57768 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX16P57768 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX16P57768 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX16P57768 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX16P57768 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX16P57768 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX16P57768 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX16P57768 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX16P57768 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX16P57768 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX16P57768 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX16P57768 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX16P57768 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX16P57768 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX16P57768 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX16P57768 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX16P57768 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX16P57768 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX16P57768 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX16P57768 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX16P57768 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX16P57768 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX16P57768 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX16P57768 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX16P57768 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX16P57768 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX16P57768 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX16P57768 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX16P57768 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX16P57768 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX16P57768 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX16P57768 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX16P57768 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX16P57768 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX16P57768 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms