Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBASH3AP57075 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBASH3AP57075 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBASH3AP57075 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms