Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN8P56748 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN8P56748 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN8P56748 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN8P56748 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN8P56748 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN8P56748 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN8P56748 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN8P56748 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN8P56748 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms