Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAV3P56539 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAV3P56539 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAV3P56539 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAV3P56539 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAV3P56539 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAV3P56539 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAV3P56539 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAV3P56539 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAV3P56539 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAV3P56539 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAV3P56539 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAV3P56539 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAV3P56539 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAV3P56539 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAV3P56539 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAV3P56539 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAV3P56539 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAV3P56539 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAV3P56539 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAV3P56539 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAV3P56539 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAV3P56539 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAV3P56539 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAV3P56539 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAV3P56539 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAV3P56539 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAV3P56539 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAV3P56539 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAV3P56539 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAV3P56539 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAV3P56539 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAV3P56539 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAV3P56539 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAV3P56539 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAV3P56539 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAV3P56539 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAV3P56539 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAV3P56539 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAV3P56539 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAV3P56539 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAV3P56539 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAV3P56539 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAV3P56539 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAV3P56539 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAV3P56539 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAV3P56539 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV3P56539 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAV3P56539 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV3P56539 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV3P56539 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV3P56539 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV3P56539 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV3P56539 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV3P56539 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV3P56539 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV3P56539 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV3P56539 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV3P56539 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV3P56539 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV3P56539 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV3P56539 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV3P56539 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV3P56539 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV3P56539 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAV3P56539 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAV3P56539 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAV3P56539 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAV3P56539 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAV3P56539 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CAV3P56539 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV3P56539 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV3P56539 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV3P56539 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV3P56539 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV3P56539 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV3P56539 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV3P56539 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAV3P56539 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms