Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFV3P56181 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFV3P56181 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFV3P56181 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFV3P56181 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFV3P56181 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFV3P56181 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFV3P56181 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFV3P56181 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFV3P56181 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms