Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3BGRP55822 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms