Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1B3P54709 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms