Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3M2P53677 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3M2P53677 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms