Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LBX1P52954 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LBX1P52954 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LBX1P52954 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LBX1P52954 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LBX1P52954 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LBX1P52954 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LBX1P52954 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LBX1P52954 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LBX1P52954 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LBX1P52954 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LBX1P52954 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LBX1P52954 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LBX1P52954 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LBX1P52954 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LBX1P52954 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LBX1P52954 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LBX1P52954 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LBX1P52954 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LBX1P52954 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LBX1P52954 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBX1P52954 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBX1P52954 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBX1P52954 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBX1P52954 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBX1P52954 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBX1P52954 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBX1P52954 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBX1P52954 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LBX1P52954 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LBX1P52954 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LBX1P52954 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LBX1P52954 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LBX1P52954 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBX1P52954 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBX1P52954 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBX1P52954 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBX1P52954 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBX1P52954 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBX1P52954 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBX1P52954 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBX1P52954 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LBX1P52954 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LBX1P52954 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBX1P52954 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBX1P52954 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBX1P52954 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LBX1P52954 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LBX1P52954 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LBX1P52954 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LBX1P52954 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBX1P52954 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBX1P52954 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBX1P52954 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBX1P52954 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBX1P52954 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBX1P52954 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBX1P52954 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBX1P52954 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBX1P52954 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBX1P52954 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBX1P52954 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBX1P52954 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBX1P52954 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LBX1P52954 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LBX1P52954 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LBX1P52954 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LBX1P52954 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LBX1P52954 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LBX1P52954 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LBX1P52954 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LBX1P52954 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LBX1P52954 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LBX1P52954 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LBX1P52954 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBX1P52954 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBX1P52954 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBX1P52954 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBX1P52954 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LBX1P52954 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBX1P52954 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBX1P52954 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LBX1P52954 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBX1P52954 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBX1P52954 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBX1P52954 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LBX1P52954 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LBX1P52954 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LBX1P52954 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LBX1P52954 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LBX1P52954 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LBX1P52954 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LBX1P52954 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LBX1P52954 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LBX1P52954 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LBX1P52954 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LBX1P52954 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LBX1P52954 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LBX1P52954 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LBX1P52954 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms