Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK3P49761 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK3P49761 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK3P49761 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK3P49761 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK3P49761 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK3P49761 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK3P49761 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK3P49761 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK3P49761 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK3P49761 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK3P49761 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK3P49761 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK3P49761 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK3P49761 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK3P49761 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK3P49761 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK3P49761 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK3P49761 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK3P49761 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK3P49761 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK3P49761 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK3P49761 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK3P49761 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK3P49761 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK3P49761 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK3P49761 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK3P49761 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK3P49761 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK3P49761 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK3P49761 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK3P49761 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK3P49761 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK3P49761 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK3P49761 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK3P49761 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK3P49761 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK3P49761 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK3P49761 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK3P49761 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK3P49761 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK3P49761 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK3P49761 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK3P49761 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK3P49761 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK3P49761 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK3P49761 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK3P49761 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK3P49761 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK3P49761 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK3P49761 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK3P49761 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK3P49761 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK3P49761 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK3P49761 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK3P49761 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK3P49761 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK3P49761 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK3P49761 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK3P49761 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK3P49761 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK3P49761 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK3P49761 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK3P49761 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK3P49761 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK3P49761 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK3P49761 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK3P49761 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK3P49761 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK3P49761 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK3P49761 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK3P49761 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK3P49761 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK3P49761 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK3P49761 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK3P49761 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK3P49761 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK3P49761 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK3P49761 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK3P49761 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK3P49761 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK3P49761 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK3P49761 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK3P49761 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK3P49761 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK3P49761 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK3P49761 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK3P49761 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK3P49761 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK3P49761 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK3P49761 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms