Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A8P48029 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A8P48029 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A8P48029 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.2 ms