Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA1P46926 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNPDA1P46926 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms