Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP13P45452 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP13P45452 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP13P45452 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP13P45452 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP13P45452 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP13P45452 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP13P45452 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP13P45452 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP13P45452 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP13P45452 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP13P45452 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP13P45452 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP13P45452 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP13P45452 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP13P45452 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP13P45452 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP13P45452 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP13P45452 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP13P45452 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP13P45452 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP13P45452 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP13P45452 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP13P45452 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP13P45452 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP13P45452 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP13P45452 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP13P45452 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP13P45452 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP13P45452 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP13P45452 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP13P45452 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP13P45452 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP13P45452 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP13P45452 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP13P45452 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP13P45452 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP13P45452 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP13P45452 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP13P45452 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP13P45452 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP13P45452 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP13P45452 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP13P45452 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP13P45452 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP13P45452 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP13P45452 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP13P45452 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP13P45452 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP13P45452 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP13P45452 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP13P45452 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP13P45452 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP13P45452 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP13P45452 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP13P45452 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP13P45452 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP13P45452 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP13P45452 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP13P45452 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP13P45452 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP13P45452 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP13P45452 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP13P45452 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP13P45452 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP13P45452 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP13P45452 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP13P45452 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP13P45452 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP13P45452 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP13P45452 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP13P45452 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP13P45452 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP13P45452 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP13P45452 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP13P45452 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP13P45452 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP13P45452 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP13P45452 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP13P45452 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP13P45452 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP13P45452 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP13P45452 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP13P45452 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP13P45452 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP13P45452 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP13P45452 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP13P45452 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP13P45452 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP13P45452 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP13P45452 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP13P45452 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP13P45452 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP13P45452 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP13P45452 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP13P45452 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP13P45452 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP13P45452 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP13P45452 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP13P45452 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms