Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYKP43405 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYKP43405 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYKP43405 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYKP43405 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYKP43405 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYKP43405 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYKP43405 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYKP43405 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYKP43405 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYKP43405 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYKP43405 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYKP43405 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYKP43405 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYKP43405 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYKP43405 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYKP43405 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYKP43405 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYKP43405 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYKP43405 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYKP43405 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYKP43405 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYKP43405 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYKP43405 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYKP43405 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYKP43405 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYKP43405 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYKP43405 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYKP43405 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYKP43405 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYKP43405 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYKP43405 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYKP43405 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYKP43405 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYKP43405 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYKP43405 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYKP43405 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYKP43405 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYKP43405 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYKP43405 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYKP43405 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYKP43405 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYKP43405 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYKP43405 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYKP43405 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYKP43405 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYKP43405 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYKP43405 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYKP43405 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYKP43405 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYKP43405 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYKP43405 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYKP43405 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYKP43405 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYKP43405 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYKP43405 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYKP43405 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYKP43405 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYKP43405 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYKP43405 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYKP43405 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYKP43405 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYKP43405 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYKP43405 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYKP43405 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYKP43405 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYKP43405 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYKP43405 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYKP43405 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYKP43405 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYKP43405 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYKP43405 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYKP43405 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYKP43405 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYKP43405 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYKP43405 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYKP43405 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYKP43405 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYKP43405 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYKP43405 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYKP43405 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYKP43405 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYKP43405 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYKP43405 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYKP43405 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYKP43405 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYKP43405 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYKP43405 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYKP43405 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYKP43405 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYKP43405 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms