Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRATP43155 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRATP43155 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRATP43155 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRATP43155 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRATP43155 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRATP43155 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRATP43155 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRATP43155 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRATP43155 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRATP43155 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRATP43155 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRATP43155 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRATP43155 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRATP43155 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRATP43155 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRATP43155 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRATP43155 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRATP43155 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRATP43155 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRATP43155 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRATP43155 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRATP43155 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRATP43155 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRATP43155 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRATP43155 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRATP43155 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRATP43155 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRATP43155 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRATP43155 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRATP43155 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRATP43155 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRATP43155 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRATP43155 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRATP43155 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRATP43155 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRATP43155 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRATP43155 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRATP43155 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRATP43155 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRATP43155 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRATP43155 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRATP43155 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRATP43155 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRATP43155 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRATP43155 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRATP43155 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRATP43155 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRATP43155 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRATP43155 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRATP43155 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRATP43155 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRATP43155 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRATP43155 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRATP43155 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRATP43155 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRATP43155 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRATP43155 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRATP43155 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRATP43155 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRATP43155 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRATP43155 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRATP43155 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRATP43155 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRATP43155 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRATP43155 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRATP43155 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRATP43155 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRATP43155 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRATP43155 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRATP43155 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRATP43155 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRATP43155 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRATP43155 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRATP43155 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRATP43155 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRATP43155 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRATP43155 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRATP43155 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRATP43155 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms