Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2IP36954 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms