Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD13P35453 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD13P35453 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXD13P35453 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms