Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABRA3P34903 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRA3P34903 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms